A minha intenção ao mostrar aquele alinhamento era dar um "exemplo da representação do alinhamento". O alinhamento que vocês irão obter deve ser diferente daquele. Teoricamente, pode ser bem diferente. Não sei se na prática será muito diferente.
O Clustal obtém o alinhamento usando um algoritmo de alinhamento progressivo, e não o algoritmo estrela. E para fazer o alinhamento progressivo ele constrói uma árvore antes que serve de guia para fazer o alinhamento progressivo.
Zé Augusto
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