Olá Prof, mesmo lendo as mensagens do fórum ainda estou com dúvidas a respeito de buracos.
Exemplo:
A-T--CTACGA
CT-GA--ATGG
A penalizacao de 30 é somente para o primeiro buraco de cada seq, os demais sao somados 6,66, independente de ser 2 buracos "--" consecutivos?
assim ficaria
A - T - - C T A C G A
C T - G A - - A T G G
0 30 30 6.66 6.66 6.66 6.66 19 9.5 19 9.5
totalizando -2*(30) + -4*(6.66) + 2*(19) + -2*(9.5) =
-60 + (-26,64) + 38 + (-19) = -67,64
teste, ignore!!!
Não! Cada vez que aparece um buraco soma -30 na pontuacão. No seu exemplo tem 4 buracos. Com isso tem que somar -120.
Zé Augusto
Zé Augusto