Padrao FASTA?

Padrao FASTA?

by Paulo Cheque Bernardo -
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Professor, na descricao do programa os exemplos esta no formato:

> CODIGO NUM BPS
Sequencia

Jáa nos exemplos daqueles arquivos .fasta, onde o senhor falou pra usar estes arquivos como exemplo, estao no formato:

> nome
Sequencia


Bom, meu EP esta usando a primeira terminologia, que é mais completa, portanto, nao da pra testar usando aqueles arquivos .fasta. Posso enviar uns arquivos contendo as sequencias juntamente com o EP? Para ser usado com os testes? Porque dai deixo as sequencias todas no padrao que estou usando...

In reply to Paulo Cheque Bernardo

Re: Padrao FASTA?

by José Augusto Soares -
O correto é o programa de alinhamento não usar nenhuma informação da descrição da seqüência, como, por exemplo, o número de bases. Eu coloquei esse número como uma forma de ajudar a verificar se a leitura estava sendo feita de forma correta.

Zé Augusto