Segue abaixo o endereço para o site do IBAM, projeto do grupo do Peskin que utiliza o SAMRAI para fazer fronteira imersa paralela adaptativa. Acho que vale a pena darmos uma olhada, talvez dê pra utilizarmos como base para o nosso código.
O endereço é:
http://www.cims.nyu.edu/~griffith/IBAMR/pmwiki.php/Main/HomePage
Forum