Os seminários de Teoria da Computação e Combinatória (TCC)
apresentam tipicamente tópicos relacionados a AA.
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Seminário de Teoria da Computação e Combinatória
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Título: Alinhamentos com Duplicações
Palestrante: Alair Pereira do Lago
Data: sexta, 25 de maio, às 14:00
Local: Anfiteatro do NUMEC-USP
Resumo:
Alinhamentos entre seqüências são umas das ferramentas mais
fundamentais no processo de estudo da biologia molecular que se
apoia sobre conhecimento das seqüências biológicas. Os modelos
e programas utilizados somente levam em consideração eventos
biológicos pontuais como inserção, remoção e substituição de
nucleotídeos nas seqüências de DNA. Eventos também importantes
como inversões e duplicações costumam ser ignorados face às
dificuldades encontradas.
Nesta palestra apresentamos modelos mais gerais que os atualmente
utilizados e que levem em consideração a presença de duplicações.
Apresentamos também algoritmos cúbicos para os problemas de
alinhamento baseados nestes modelos, melhorando resultados
publicados por Benson em 1997.
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Para mais informações sobre o seminário de TCC, visite a página:
http://www.ime.usp.br/~cris/seminarios/
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