Seminário: Identificação de genes por alinhamento de seqüências

Seminário: Identificação de genes por alinhamento de seqüências

por José Augusto Soares -
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Título: Identificação de genes por alinhamento de seqüências

Palestrante: Said Sadique Adi

Local: Sala 241, Bloco A (A SER CONFIRMADO)

Data: quarta-feira, 24 de novembro, às 16:00


O problema da identificação de genes consiste em, dada uma seqüência de DNA, encontrar os limites dos éxons nela presentes. Essa não é uma tarefa fácil dada a presença de longos íntrons na seqüência e a falta de um padrão dos nucleotídeos componentes dos éxons que permita distinguí-los das regiões não-codificantes. Considerando-se o princípio da conservação de bases, uma das tentativas de solução desse problema envolve a comparação da seqüência de interesse com outra seqüência similar a ela. Nesse seminário apresentaremos uma heurística e um algorimo que utilizam-se do alinhamento entre duas seqüências na busca pelos seus éxons.

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Atividade dentro do projeto PRONEX Complexidade de Estruturas Discretas (Projeto ProNEx 107/97; Proc. CNPq 664107/1997-4) e do Projeto Temático ProNEx Foundations of Computer Science: Combinatorial Algorithms and Discrete Structures (FAPESP/CNPq Proc. No. 2003/09925-5)
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